Мученицька смерть святого страстотерпця Афанасія, ігумена Брестського, сталася 5 вересня 1648 (відомості про життя і подвиг поміщені в цей день). Протягом восьми місяців тіло страждальця за Православ'я лежало в землі без церковного відспівування. 1 травня 1649 року один хлопчик вказав братії Брестського монастиря Святого Симеона Стовпника місце поховання ігумена. Земля, в якій був похований мученик, виявилася тимчасово належала єзуїтам, тому довелося діяти таємно. Вночі ченці викопали нетлінне тіло ігумена і негайно перенесли на інше місце, а вранці - до свого монастиря, де через кілька днів, 8 травня, з честю поховали біля правого крилосу в головному храмі монастиря на честь преподобного Симеона Стовпника.

Земне життя преподобномученика Афанасія припинилася, але пам'ять про нього завжди залишалася живою і священною серед православного населення західноруського краю. Глибоко шанувалося тут віруючими його святе ім'я, а нетлінні мощі святого преподобномученика, покладені в мідну раку, були прославлені благодатним даром чудотворення і залучали величезну кількість віруючих.

8 листопада 1815 року під час пожежі, що сталася у Брестському Свято-Симеонівському монастирі, згоріла дерев'яна монастирська церква, а мідна рака, в якій зберігалися мощі преподобномученика, розплавилася в полум'ї пожежі. На наступний день після пожежі вцілілі частки мощей були знайдені священиком Самуїлом Лисовським і благочестивими жителями міста Бреста і покладені під вівтарем монастирської трапезної церкви. У 1823 році святі мощі, з благословення архієпископа Мінського Анатолія, настоятель обителі переклав у дерев'яний ковчег і поставив у церкві для поклоніння.

Богу завгодно було дарувати чудотворну силу і цим збереженим часткам мощей преподобномученика Афанасія.

У високих натхненних рисах воскресає перед нами цей священний образ великого поборника Православ'я, не пощадив заради віри і ближніх свого життя. Глибоко релігійний, беззастережно відданий вірі своїх батьків, він обурюється духом і висловлює словом і ділом свій священний гнів проти утисків православних християн гордовитими латино-уніатами. З твердою вірою в своє покликання Богом він виступає на боротьбу за своїх пригноблених побратимів. "Я не пророк, а тільки слуга Бога Творця мого, посланий згідно з часом, щоб говорити кожному правду... Він для того послав мене, щоб я наперед сповістив про винищення проклятої унії". Такими були слова твердого, непохитного і натхненного борця за Православ'я, глибоко вірив у переможну силу істинного сповідання.

Всеціле утвердження Православ'я і остаточне, повне знищення унії - ось у чому бачив святий Афанасій свою єдину мету, за здійснення якої він віддав своє святе життя. Крім цієї мети, для нього не існувало іншого, бо він вже не жив своїм особистим життям. Скоряючись волі Божої, він не замислювався над небезпеками, не дивився на перешкоди, щоб виконати свій святий обов'язок. Сміливі, натхненні промови та письмові клопотання, публічні скарги на зборах і добровільне юродство у Христі - всі ці засоби застосовувалися преподобномучеником Афанасієм для досягнення і торжества заповітної мети - утвердження Православ'я на древній українській землі. Проте, відкидаючи унію, він переймався глибоким почуттям братнього співчуття і любові до тих, хто став жертвою уніатського впливу. Праведність і щирість у ставленні до ближніх відрізняли святого Афанасія протягом усього подвигу. По суті на самоті, оточений явними і прихованими ворогами, святий подвижник залишався непорушним захисником і стовпом Православ'я, зміцнюваний тільки світлою вірою в його торжество і істинність. Не лякала його мученицька смерть, тому що він передбачав виконання свого пророчого передбачення: "Унія зникне, а Православ'я зацвіте".