Про походження і ранні роки преподобного Ферапонта Монзенського, його життя відомостей не збереглося. Почав він свої подвиги в Москві (ймовірно, що юродствував, наслідуючи блаженному Василію Московському), потім перейшов до Костромського Воздвиженського монастиря, де, прийнявши чернечий постриг, прожив 13 років. Ще за життя святий прославився чудотворенням.

Одного разу преподобний Ферапонт явився у сні двом ченцям Павло-Обнорського монастиря Пафнутію і Андріану і повелів заснувати обитель на березі річки Монзи (поблизу Солігалича). Уникаючи слави людської, преподобний віддалився з Воздвиженського монастиря і якийсь час жив відлюдником. Коли монастир на річці Монзі був побудований старцем Андріаном, преподобний прославив його двома чудесами: з'явившись уві сні рибалці з Солігалича і коваля з Буя, у яких хворіли сини, він передбачив, що їхні діти уздоровляться у нововлаштованому Благовіщенському монастирі на річці Монзі. І дійсно, привезені в монастир, обидва юнаки зцілилися.

Через деякий час преподобний Ферапонт сам прийшов до Благовіщенської обитель і просив ігумена, старця Андріана, стати його духовним отцем. Під час сповіді Андріан був приголомшений душевною чистотою преподобного, силою його віри. Два роки перебування преподобного Ферапонта в Монзенському монастирі були часом великого смирення, лагідності та аскетичних подвигів. Благовіщенський монастир був завжди дорогий преподобному: він чудово сприяв його облаштування і перенесення на нове місце, захищав від недоброзичливців, дивовижним чином вишукував кошти для його утримання.

Передбачивши день свого спочинку, святий попрощався з братією і мирно спочив 12 грудня 1597 року. Перед смертю він дуже просив, щоб йому, вже померлому, дали Богоявленської святої води. Виконуючи волю покійного, йому дали святої води, і він проковтнув її. У літописі монастиря описані численні зцілення, що відбувалися біля гробу преподобного. Одного разу святий врятував кораблі від загибелі при проходженні через «пороги» на річці Костромі, прямо навпроти Благовіщенського монастиря, причому деякі бачили благоліпного старця, що сідав на корму кожного струга та скеровував у небезпечному місці. Також, з'явившись уві сні ігумену монастиря, преподобний передбачив голод 1601 і повелів запасти більше хліба.

Через 20 років після спочинку преподобного були знайдені його нетлінні мощі, причому навіть ризи були цілими.